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       本项目旨在建立精准医学研究所需的程序资源,包括源代码、数据分析流程等。本项目遵从Apache License 2.0 开源协议。

       本项目欢迎所有志在从事精准医疗相关工作的人员参与,为保证所有参与人员可以方便的交流沟通,项目建立了开源社区,地址是:http://private.synergylab.info/confluence。

       本项目内所有的子项目,在进行之前均需规划开发路线,包括所需要的技术、资源,预期达成怎样的目标等。

      

项目包含以下几个方面:

  1. 建立完整的GSLA工具体系,包括开发本地应用程序、实现与GenomeSpace分析平台的连接、开发从生物途径到具体研究报道的文献挖掘工具;
  2. 基于深度学习,建立具有生物学意义,可以用于表征疾病或其他生物性状的基因集;
  3. 研发GIPS3.0版,实现由突变基因集来表征疾病;
  4. 开发基于深度学习的肿瘤细胞形态识别技术;
  5. 开发将生物途径关联到已发表文章的文献挖掘系统;
  6. 建立并优化精准医学分析流程。

 

按照计划,本项目将首先建立完整的GSLA工具体系,目前已启动了GSLA本地化应用程序开发,预计一个月完成,整个工具体系将在4个月内搭建完毕。后续开发内容包括建立精准医学知识库系统、建精准医学分析流程、开发病理匹配系统,将具体拟定开发进度。

 

       参与本项目的人员需遵守本项目制定的代码规范及管理规范,包括变量名称的命名,注释文档的编写,代码分支的维护等。

       项目需遵守快速迭代的思想,即及时发布,及时反馈,及时改进。

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